MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Nitrosococcus oceani ATCC 19707 chromosome

Total Repeats: 67890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007484	CTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_007484	ACC	2	6	206	211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	77163562
3	NC_007484	GCAA	2	8	261	268	50 %	0 %	25 %	25 %	77163562
4	NC_007484	ACA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	77163562
5	NC_007484	ATTG	2	8	316	323	25 %	50 %	25 %	0 %	77163562
6	NC_007484	TAT	2	6	359	364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163562
7	NC_007484	AGC	2	6	373	378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
8	NC_007484	CTT	2	6	397	402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
9	NC_007484	AGGT	2	8	404	411	25 %	25 %	50 %	0 %	77163562
10	NC_007484	CAGCCT	2	12	424	435	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	77163562
11	NC_007484	CTT	2	6	476	481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
12	NC_007484	AGT	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
13	NC_007484	CAAT	2	8	558	565	50 %	25 %	0 %	25 %	77163562
14	NC_007484	GCT	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
15	NC_007484	ATGC	2	8	664	671	25 %	25 %	25 %	25 %	77163562
16	NC_007484	CGA	2	6	822	827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163562
17	NC_007484	T	6	6	835	840	0 %	100 %	0 %	0 %	77163562
18	NC_007484	T	7	7	868	874	0 %	100 %	0 %	0 %	77163562
19	NC_007484	AAT	2	6	909	914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163562
20	NC_007484	TGA	2	6	1037	1042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
21	NC_007484	A	6	6	1259	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	77163562
22	NC_007484	ATC	2	6	1302	1307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
23	NC_007484	GTA	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163562
24	NC_007484	CTCGGC	2	12	1331	1342	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	77163562
25	NC_007484	TTC	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163562
26	NC_007484	GGT	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	77163562
27	NC_007484	TAC	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163562
28	NC_007484	TCG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163562
29	NC_007484	A	6	6	1506	1511	100 %	0 %	0 %	0 %	77163562
30	NC_007484	TAAT	2	8	1645	1652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_007484	TATAAA	2	12	1654	1665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_007484	ATG	2	6	1690	1695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_007484	CACTAT	2	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_007484	AT	4	8	1715	1722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_007484	CTT	2	6	1819	1824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_007484	CGG	2	6	1864	1869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_007484	GGA	2	6	1880	1885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_007484	ATA	2	6	1963	1968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007484	TTCA	2	8	2079	2086	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_007484	A	6	6	2217	2222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007484	ATC	2	6	2262	2267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_007484	AGC	2	6	2282	2287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_007484	AAT	2	6	2290	2295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007484	TA	3	6	2305	2310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_007484	AAT	2	6	2342	2347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_007484	CTTG	2	8	2365	2372	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_007484	AGA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
48	NC_007484	GTA	2	6	2453	2458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
49	NC_007484	ACG	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
50	NC_007484	TTGAAA	2	12	2541	2552	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	77163563
51	NC_007484	AGA	2	6	2581	2586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
52	NC_007484	CTTC	2	8	2636	2643	0 %	50 %	0 %	50 %	77163563
53	NC_007484	AAG	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
54	NC_007484	ATTC	2	8	2687	2694	25 %	50 %	0 %	25 %	77163563
55	NC_007484	CTG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
56	NC_007484	ATT	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
57	NC_007484	TCA	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	77163563
58	NC_007484	TAT	2	6	2865	2870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
59	NC_007484	GAA	2	6	2882	2887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
60	NC_007484	CTT	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	77163563
61	NC_007484	TTG	2	6	3165	3170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
62	NC_007484	CTG	2	6	3300	3305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	77163563
63	NC_007484	TAA	2	6	3355	3360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	77163563
64	NC_007484	ATT	2	6	3386	3391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	77163563
65	NC_007484	AAG	2	6	3399	3404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	77163563
66	NC_007484	TAG	3	9	3427	3435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	77163563
67	NC_007484	AGTA	2	8	3467	3474	50 %	25 %	25 %	0 %	77163563
68	NC_007484	TGT	2	6	3475	3480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	77163563
69	NC_007484	GAC	2	6	3499	3504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	77163563
70	NC_007484	GGAA	2	8	3533	3540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_007484	GA	3	6	3542	3547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_007484	AAG	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_007484	T	6	6	3596	3601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007484	GT	3	6	3645	3650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007484	TCA	2	6	3651	3656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_007484	TCGC	2	8	3658	3665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_007484	CCAG	2	8	3673	3680	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_007484	ACG	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_007484	CGA	2	6	3694	3699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_007484	GCT	2	6	3815	3820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_007484	CA	3	6	3823	3828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_007484	TTA	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_007484	CTT	2	6	3953	3958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_007484	CCGTGT	2	12	3986	3997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_007484	T	7	7	4078	4084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_007484	CAG	2	6	4096	4101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_007484	CCT	2	6	4106	4111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_007484	GCC	2	6	4294	4299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_007484	GCGGTA	2	12	4338	4349	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_007484	TCA	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_007484	CAA	2	6	4476	4481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_007484	GCC	2	6	4484	4489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_007484	CTT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_007484	GGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_007484	GCGTTT	2	12	4581	4592	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_007484	T	8	8	4779	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007484	CG	3	6	4846	4851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_007484	CTC	2	6	4876	4881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_007484	CTT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_007484	AGC	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_007484	CTT	2	6	4933	4938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_007484	ATC	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_007484	ACC	2	6	5020	5025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_007484	T	6	6	5027	5032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_007484	AG	3	6	5038	5043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_007484	GGC	2	6	5044	5049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_007484	CT	3	6	5050	5055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_007484	TAA	2	6	5083	5088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_007484	TTA	2	6	5098	5103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_007484	ACT	2	6	5110	5115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_007484	CAA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_007484	AAG	2	6	5289	5294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_007484	ATT	3	9	5359	5367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_007484	GCA	2	6	5404	5409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_007484	CAG	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_007484	GGC	2	6	5468	5473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_007484	TAGCTA	2	12	5523	5534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_007484	CTTG	2	8	5539	5546	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_007484	AACGG	2	10	5551	5560	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_007484	TTAGCC	2	12	5604	5615	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_007484	GGC	2	6	5641	5646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_007484	GGA	2	6	5772	5777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_007484	AAAT	2	8	6008	6015	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_007484	A	6	6	6019	6024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_007484	AAG	2	6	6065	6070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007484	CGGG	2	8	6111	6118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
127	NC_007484	GCC	2	6	6126	6131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_007484	TCA	2	6	6161	6166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_007484	CAG	2	6	6189	6194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_007484	T	7	7	6246	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007484	CTT	2	6	6270	6275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_007484	GC	3	6	6295	6300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_007484	TTC	2	6	6373	6378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_007484	G	6	6	6421	6426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
135	NC_007484	GCT	2	6	6437	6442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_007484	CCG	2	6	6458	6463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_007484	CAT	2	6	6485	6490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_007484	AAGG	2	8	6555	6562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_007484	GCTC	2	8	6616	6623	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_007484	CTG	2	6	6670	6675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_007484	GGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_007484	TCA	2	6	6735	6740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_007484	GAA	2	6	6802	6807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_007484	CAG	2	6	6830	6835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_007484	CAG	2	6	6879	6884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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